Fusagasugá se encuentra entre los municipios con mayor número de casos confirmados de dengue en el departamento, junto a Girardot, Ricaurte, Villeta y El Colegio. Según lo informó la Gobernación de Cundinamarca el 22 de mayo de 2025, el municipio enfrenta un repunte significativo durante la actual temporada invernal, lo que ha llevado a intensificar las acciones de prevención y control del vector transmisor.
Hasta la fecha, el departamento ha registrado 2.162 casos confirmados por laboratorio, sin muertes asociadas, y Fusagasugá representa una parte importante de esa cifra. Las autoridades locales adelantan jornadas de recolección de inservibles, fumigación focalizada y sensibilización comunitaria para frenar la propagación del mosquito Aedes aegypti.